За время наблюдения число видов рыб и круглоротых сократилось примерно со 140 до 80. На экосистему негативно влияют рыболовство, загрязнение, появление новых видов и осолонение моря.
При этом Азовское море долгое время считалось одним из самых продуктивных водоемов в мире. По историческим данным, общая биомасса рыбы здесь достигала около 1,3 млн тонн, а ежегодный вылов — до 400 тыс. тонн. Основу промысла составляли осетровые, лещ, сазан, тарань и другие ценные виды рыб.
С 2007 года соленость воды увеличивается примерно на 0,25‰ в год — и теперь она составляет около 15‰ вместо прежних 10. Из-за этого экосистема меняется: в Азовском море стало больше хамсы, бычков, пиленгаса и медуз.
Такие изменения затрагивают всю пищевую цепочку Азовского моря. Когда одни виды сокращаются, а другие начинают занимать больше места, меняется доступность пищи и условия для размножения рыб. Со временем это отражается и на промысле: привычных видов становится меньше, а состав уловов постепенно меняется. Если осолонение продолжится теми же темпами, экосистеме придется дальше приспосабливаться к новым условиям.